注）本ファイルは２００１年省庁再編後の組織図に照らして、各省庁ホームページに掲載された訳語、および首相官邸ホームページ英語版を参考に、表記したものである。(2009年3月11日更新）
| 内閣 | ないかく | Cabinet | ||
| 内閣官房 | ないかくかんぼう | Cabinet Secretariat | ||
| 内閣法制局 | ないかくほうせいきょく | Cabinet Legislation Office | ||
| 人事院 | じんじいん | National Personnel Authority | ||
| 内閣府 | ないかくふ | Cabinet Office | ||
| 宮内庁 | くないちょう | The Imperial Household Agency | ||
| 公正取引委員会 | こうせいとりひきいいんかい | Japan Fair Trade Commission | ||
| 国家公安委員会 | こっかこうあんいいんかい | National Public Safety Commission | ||
| 警察庁 | けいさつちょう | National Police Agency | ||
| 金融庁 | きんゆうちょう | Financial Services Agency | ||
| 総務省 | そうむしょう | Ministry of Internal Affairs and Communications | ||
| 公害等調整委員会 | こうがいとうちょうせいいいんかい | Environmental Dispute Coordination Commission | ||
| 消防庁 | しょうぼうちょう | Fire and Disater Management Agency | ||
| 法務省 | ほうむしょう | Ministry of Justice | ||
| 公安調査庁 | こうあんちょうさちょう | Public Security Intelligence Agency | ||
| 外務省 | がいむしょう | Ministry of Foreign Affairs | ||
| 財務省 | ざいむしょう | Ministry of Finance | ||
| 国税庁 | こくぜいちょう | National Tax Agency | ||
| 文部科学省 | もんぶかがくしょう | Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology | ||
| 文化庁 | ぶんかちょう | Agency for Cultural Affairs | ||
| 厚生労働省 | こうせいろうどうしょう | Ministry of Health, Labour and Welfare | ||
| 中央労働委員会 | ちゅうおうろうどういいんかい | Central Labour Relations Commission | ||
| 社会保険庁 | しゃかいほけんちょう | Social Insurance Agency | ||
| 農林水産省 | のうりんすいさんしょう | Ministry of Agriculture, Forestry and Fisheries | ||
| 林野庁 | りんやちょう | Forestry Agency | ||
| 水産庁 | すいさんちょう | Fisheries Agency | ||
| 経済産業省 | けいざいさんぎょうしょう | Ministry of Economy, Trade and Industry | ||
| 資源エネルギー庁 | しげんえねるぎーちょう | Agency of Natural Resources and Energy | ||
| 特許庁 | とっきょちょう | Japan Patent Office | ||
| 中小企業庁 | ちゅうしょうきぎょうちょう | Small and Medium Enterprise Agency (SME) | ||
| 国土交通省 | こくどこうつうしょう | Ministry of Land, Infrastructure, Transport and Tourism | ||
| 観光庁 | かんこうちょう | Japan Tourism Agency | ||
| 気象庁 | きしょうちょう | Japan Meteorological Agency | ||
| 運輸安全委員会 | うんゆあんぜんいいんかい | Transport Safety Board | ||
| 海上保安庁 | かいじょうほあんちょう | Japan Coast Guard | ||
| 環境省 | かんきょうしょう | Ministry of the Environment | ||
| 防衛省 | ぼうえいしょう | Ministry of Defense | ||
| 会計検査院 | かいけいけんさいん | Board of Audit | ||
| 国会 | こっかい | Diet | ||
| 衆議院 | しゅうぎいん | House of Representatives | ||
| 参議院 | さんぎいん | House of Councillors | ||
| 裁判官弾劾裁判所 | さいばんかんだんがいさいばんしょ | Judges Impeachment Court | ||
| 裁判官訴追委員会 | さいばんかんそついいいんかい | Judges Indictment Court | ||
| 国立国会図書館 | こくりつこっかいとしょかん | National Diet Library | ||
| 最高裁判所 | さいこうさいばんしょ | Supreme Court | ||
| 日本銀行 | にっぽんぎんこう | Bank of Japan |